Ученые смогли разработать
уникальный метод изучения тандемных повторов, с помощью которого они смогли
обнаружить новую повторяющуюся последовательность ДНК в геноме курицы.
Исследование проводили специалисты Санкт-Петербургского государственного
университета.
Известно, что в геномах высокоорганизованных
организмов существует множество последовательностей, ряд из которых
представляет собой тандемные повторы. При этом изменение числа этих повторов
может стать причиной некоторых серьезных заболеваний. Однако расшифровка таких
последовательностей зачастую становится нерешаемой задачей.
Уникальный подход разработал старший научный сотрудник Центра
геномной биоинформатики имени Ф. Г. Добржанского СПбГУ Алексей
Комиссаров. Он позволяет находить и исследовать ранее неизвестные тандемные
повторы, а также проводить их количественную оценку.
Новую технологию опробовали на домашних курицах.
Исследование проводила группа экспертов под руководством директора ресурсного
центра «Хромас» Научного парка СПбГУ Алсу Сайфитдиновой.
Так, у птиц женский пол определятся разными хромосомами Z
и W, а представители мужского пола имеют две одинаковые Z-хромосомы. Именно непарная хромосома способствует
накоплению тандемно повторенных последовательностей. С помощью высокоразрешающего
картирования специалисты смогли определить новую локацию тандемной
последовательности с высокой точностью.
«Некоторые исследователи считают,
что ключевым моментом в формировании генетического определения пола и эволюции
половых хромосом является тот момент, когда одна из хромосом приобретает
функции определения пола. Несмотря на все усилия, в составе W-хромосомы птиц не
удалось найти ген, который мог бы претендовать на роль такого регулятора. В то
же время появляется все больше данных о том, что тандемные повторы могут
выполнять регуляторные функции и влиять на уровень активности некоторых генов»,
— рассказала Алсу Сайфитдинова.
Благодаря научному открытию ученые смогут разобраться, почему возникают
некоторые заболевания и ка формируется пол. Кроме того, им удастся выяснить,
как на эти процессы влияют внешние факторы.